Campus researchers make history with release of first human pangenome

UC Santa Cruz
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Dear Campus Community,

We are extremely proud to share the news that UC Santa Cruz scientists played a critical role in an enormous scientific achievement that boosts our understanding of human biology and genomic diversity, and will ultimately help diagnose disease and guide treatments for people worldwide.  

The Human Pangenome Reference Consortium (HPRC)—co-led by UCSC’s Associate Professor of Biomolecular Engineering Benedict Paten and Assistant Professor of Biomolecular Engineering Karen Miga—today released a draft of the first human pangenome, which combines the genetic material of 47 individuals from different ancestral backgrounds. More than a dozen researchers from our Genomics Institute including several student researchers have been involved with this project, which will continue into 2024, when researchers expect to release a final version of the pangenome with genomic information from 350 individuals.

The pangenome is significant in that it gives scientists a deeper, more accurate, and more inclusive understanding of worldwide genomic diversity, allowing for more detailed genomic analyses. Even in its draft form of 47 sequences, the pangenome has already proven to be more effective at detecting variants. Having this information helps scientists better understand how various genes and diseases are inherited, for example, and provides valuable insights into human health.

The pangenome is the latest achievement in a sustained effort by UC Santa Cruz researchers to decipher the chemical makeup of the human genetic code.

UC Santa Cruz made history in 2000, when then-graduate student Jim Kent, now a research scientist at the Genomics Institute, wrote the code that allowed the publicly funded Human Genome Project to assemble and publish the first human genome sequence. The mapping is considered one of the greatest scientific feats in history. Last spring, the Telomere-to-Telomere Consortium, co-led by Prof. Miga, announced it had assembled the first complete sequencing of a human genome, filling in missing, complex regions that had long eluded scientists because of the limitations of DNA-sequencing technologies.

The pangenome is another huge scientific step forward. Please join us in recognizing this remarkable achievement. Congratulations to all in our campus community who played a role.

Sincerely,

Cindy and Lori

 

Cynthia Larive

UC Santa Cruz Chancellor

Lori Kletzer
Campus Provost and Executive Vice Chancellor

Investigadores del Campus hacen historia con la divulgación del primer pangenoma humano

 

Nos enorgullece en extremo compartir la noticia de científicos de la UC Santa Cruz desempeñaron un papel crítico en un enorme logro científico que impulsa nuestra comprensión de la biología humana y la diversidad genómica, y que a la larga ayudará a diagnosticar enfermedades y guiar los tratamientos de gentes por todo el mundo.

 

El Consorcio de Referencia sobre el Pangenoma Humano (HPRC, por sus siglas en inglés) — co-dirigido por el Profesor Asociado de Ingeniería Biomolecular de la UCSC Benedict Paten y la Profesora Asistente de Ingeniería Biomolecular Karen Miga — dio a conocer hoy un borrador de el primer pangenoma humano, el cual combina material genético de 47 individuos de diferentes antecedentes ancestrales. Más de una docena de investigadores de nuestro Instituto de Genómica, inclusive varios estudiantes investigadores han estado involucrados en este proyecto, el cual continuará hasta el 2024, fecha en la cual los investigadores esperan divulgar una versión final del pangenoma con información  genómica de 350 individuos.

 

El pangenoma es significativo en que les da a los científicos una comprensión más profunda, más exacta y más inclusiva de de la diversidad genómica mundial, permitiendo así hacer análisis genómicos más detallados. Aún a nivel de borrador de 47 secuencias, el pangenoma ya se ha probado como más efectivo en la detección de variantes. El tener esta información ayuda a los científicos a entender mejor cómo se heredan varios genes y enfermedades, por ejemplo, y proporciona perspectivas valiosas sobre la salud humana.

 

El pangenoma es lo último en logros debido a los esfuerzos sostenidos de los investigadores de la UC Santa Cruz a fin de descifrar la composición química del código genético humano.

 

La UC Santa Cruz hizo historia en el 2000, cuando el entonces estudiante de posgrado Jim Kent, ahora científico investigador del Instituto de Genómica, escribió el código que permitió al Proyecto del Genoma Humano, financiado con fondos públicos, ensamblar y publicar la primera secuencia del genoma humano. El trazado está considerado una de las hazañas científicas más grandes de la historia. La primavera pasada, el Consorcio Telomero-a-Telomero, co-dirigido por la Profesora Miga, anunció que había ensamblado la primera secuencia completa de un genoma humano, supliendo lo que falta en regiones complejas que durante mucho tiempo se habían escabullido de los científicos, debido a las limitaciones de las tecnologías conocidas para las secuencias del ADN.

 

El pangenoma es otro enorme paso adelante de la ciencia. Por favor, súmense a nosotros en reconocer este logro notable. Congratulaciones a todos los de nuestra comunidad del campus que desempeñaron un papel en esta obra.

 

Atentamente,
Cindy y Lori

 

Cynthia Larive
Rectora

Lori Kletzer
Preboste del Campus y Vicerrectora Ejecutiva
 

UC Santa Cruz
1156 High St., Santa Cruz, CA 95064
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